RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NR2E1Q9Y466 385 aa14.94□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GPR182O15218 404 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CXCL14O95715 111 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NPR3P17342 541 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LAG3P18627 525 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMARCA1P28370 1054 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FLCNQ8NFG4 579 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NCOA7Q8NI08 942 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.93□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GPR32O75388 356 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 VTNP04004 478 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CES5AQ6NT32 575 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPG21Q9NZD8 308 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EVPLQ92817 2033 aa14.92□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HBP1O60381 514 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EPCAMP16422 314 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CLCN5P51795 746 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KRT17Q04695 432 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RNF169Q8NCN4 708 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CASP10Q92851 521 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF558Q96NG5 402 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAP3K14Q99558 947 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SDF4Q9BRK5 362 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NFASCO94856 1347 aa14.91□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FSD2A1L4K1 749 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MEIS1O00470 390 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BACH1O14867 736 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF5BP33176 963 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CA8P35219 290 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ITIH3Q06033 890 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 METTL13Q8N6R0 699 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.9□□□□□ -0.02
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C22orf31O95567 290 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FGFR4P22455 802 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MTHFRP42898 656 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CEP55Q53EZ4 464 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HELQQ8TDG4 1101 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF302Q9NR11 478 aa14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADAMTS3O15072 1205 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRC1O43663 620 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DDAH1O94760 285 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHMLP26374 656 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GNAQP50148 359 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CLCN3P51790 818 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BCAR1P56945 870 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MCTP2Q6DN12 878 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RMDN1Q96DB5 314 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.88□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.87□□□□□ -0.03
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms