RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 MAFGO15525 162 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCNE2O96020 404 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 RXRAP19793 462 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM189BP81408 668 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 MCTP2Q6DN12 878 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 CES5AQ6NT32 575 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 KANK3Q6NY19 840 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMC7Q7Z402 723 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 LRRC43Q8N309 656 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF558Q96NG5 402 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 SDF4Q9BRK5 362 aa22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPR182O15218 404 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATG7O95352 703 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 SMARCA1P28370 1054 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIF5BP33176 963 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPM1AP35813 382 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 ITIH3Q06033 890 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 PGBD1Q96JS3 809 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 WDR81Q562E7 1941 aa22.59■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 VTNP04004 478 aa22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL1A2P08123 1366 aa22.58■■□□□ 1.21
SPDYE2B-202ENST00000455020 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 HBP1O60381 514 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPR32O75388 356 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 C22orf31O95567 290 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 IGHDP01880 384 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 MTHFRP42898 656 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC26A2P50443 739 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CLCN5P51795 746 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 FLCNQ8NFG4 579 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPG21Q9NZD8 308 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.57■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CEP250Q9BV73 2442 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 PI15O43692 258 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATP4AP20648 1035 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ODR4Q5SWX8 454 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.56■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 BACH1O14867 736 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 NPR3P17342 541 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 KRT17Q04695 432 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.55■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CACNA1BQ00975 2339 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 EPCAMP16422 314 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 AOC1P19801 751 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CA8P35219 290 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CEP55Q53EZ4 464 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.54■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 HOXA2O43364 376 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 EOMESO95936 686 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 GNAQP50148 359 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CLCN3P51790 818 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ANGPT1Q15389 498 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ABI1Q8IZP0 508 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 RNF169Q8NCN4 708 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 ANO3Q9BYT9 981 aa22.53■■□□□ 1.2
SPDYE2B-202ENST00000455020 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms