RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OPA1	O60313	960 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	GAS7	O60861	476 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FER	P16591	822 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	GUCY2D	Q02846	1103 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	PAK2	Q13177	524 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	VPS36	Q86VN1	386 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	NACC1	Q96RE7	527 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	KRT12	Q99456	494 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	DMAC2	Q9NW81	257 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G6	O60733	806 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	GFPT2	O94808	682 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FAM151A	Q8WW52	585 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK3	O14649	394 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	TNNC1	P63316	161 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	PPFIA1	Q13136	1202 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	H2AFV	Q71UI9	128 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	MREG	Q8N565	214 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	NFU1	Q9UMS0	254 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	HSF2BP	O75031	334 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	STAT1	P42224	750 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FMO5	P49326	533 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	UBXN2A	P68543	259 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	COG2	Q14746	738 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SCFD2	Q8WU76	684 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	CNTNAP1	P78357	1384 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ESYT3	A0FGR9	886 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FAM153B	P0C7A2	387 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	AR	P10275	920 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FAM153C	Q494X1	144 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	IQCK	Q8N0W5	287 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	VCPKMT	Q9H867	229 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058		F8VZ95	297 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	RAD51C	O43502	376 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	GUCY2C	P25092	1073 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	SOX5	P35711	763 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	NPEPPS	P55786	919 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	KSR1	Q8IVT5	923 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	STRA6	Q9BX79	667 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	STK33	Q9BYT3	514 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TOM1-210	ENST00000449058	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	EVI5	O60447	810 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PPP2R5A	Q15172	486 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	FAM160B2	Q86V87	743 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	IFT81	Q8WYA0	676 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ZIM3	Q96PE6	472 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SYT11	Q9BT88	431 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	WHAMM	Q8TF30	809 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54	6e-8	■■■■□ 24
TOM1-210	ENST00000449058	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PPFIA4	O75335	1185 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	PPP1R37	O75864	691 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	MAPK7	Q13164	816 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	TTMP	Q5BVD1	217 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TOM1-210	ENST00000449058	ODR4	Q5SWX8	454 aa		18.44	■□□□□ 0.54

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