RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 CCND2P30279 289 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TECP42680 631 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP4P98171 946 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 KRT17Q04695 432 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MSS51Q4VC12 460 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FAM26DQ5JW98 314 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TBC1D5Q92609 795 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PXMP2Q9NR77 195 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 KAT6AQ92794 2004 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MYO10Q9HD67 2058 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 STAM2O75886 525 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 AVPP01185 164 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CHRNA1P02708 482 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 LGALS2P05162 132 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SDHBP21912 280 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SCNN1AP37088 669 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 NOVP48745 357 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ODR4Q5SWX8 454 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 IQCA1Q86XH1 822 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 DGKHQ86XP1 1220 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 THNSL1Q8IYQ7 743 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FLCNQ8NFG4 579 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ESR2Q92731 530 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 AMNQ9BXJ7 453 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 KAT14Q9H8E8 782 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TMEM260Q9NX78 707 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MYH7P12883 1935 aa5.93□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FGAP02671 866 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FGRP09769 529 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 POLR2MP0CAP2 368 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 DNAJB1P25685 340 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 MTHFRP42898 656 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 NT5C2P49902 561 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ITIH3Q06033 890 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 DPYDQ12882 1025 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CAMK1Q14012 370 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 LPIN1Q14693 890 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ALX1Q15699 326 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 METTL7BQ6UX53 244 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ATP8B4Q8TF62 1192 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SUSD6Q92537 303 aa5.92□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 BAP1Q92560 729 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms