RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHB6O15197 1021 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NTSR2O95665 410 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL1P05976 194 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCD1P33897 745 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK17Q00537 523 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KLC1Q07866 573 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CUL1Q13616 776 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP10Q86W26 655 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ADSSL1Q8N142 457 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 USP38Q8NB14 1042 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PHC3Q8NDX5 983 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF4BQ92750 862 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPTQ96BT3 561 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SETDB2Q96T68 719 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB17Q9H0T7 212 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TSKSQ9UJT2 592 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC42Q9Y546 428 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DAPK3O43293 454 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB7AO95365 584 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MYBP10242 640 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNAR1P17181 557 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNA3P22001 575 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 STAT6P42226 847 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF131P52739 623 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR3Q13615 1198 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TLCD1Q96CP7 247 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MASTLQ96GX5 879 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FGD4Q96M96 766 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RMND1Q9NWS8 449 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SLX4Q8IY92 1834 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 F8VZ95 297 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1C1P21283 382 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SDE2Q6IQ49 451 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 BICD1Q96G01 975 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT74Q96LB3 600 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST12Q9NRB3 414 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCF2Q9UG63 623 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RECKO95980 971 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GNAZP19086 355 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA6P23229 1130 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH1B1P30837 517 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GBP1P32455 592 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5C2P49902 561 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RCAN1P53805 252 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 BNIP1Q12981 228 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MYBPC3Q14896 1274 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RRAGAQ7L523 313 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 FERMT2Q96AC1 680 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM87BQ96K49 555 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PBKQ96KB5 322 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PIM2Q9P1W9 311 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC53A6NM62 1247 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 H0Y3Z8 333 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ABLIM1O14639 778 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK3O14649 394 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA7O14818 248 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PJA2O43164 708 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX3O60493 162 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1G1O75348 118 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGDRQ13258 359 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RTN1Q16799 776 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNTL6Q49A17 601 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms