RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 NTRK3Q16288 839 aa22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 CD207Q9UJ71 328 aa22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ELL3-202ENST00000433927 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 C9IYK1 514 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 MBTPS2O43462 519 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 DCXO43602 365 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 VTNP04004 478 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 USP11P51784 963 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 WDR81Q562E7 1941 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 MAP7D2Q96T17 732 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.95■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 LINC01565O15544 149 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TBX10O75333 385 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 GPR32O75388 356 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EVCP57679 992 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 UBE3AQ05086 875 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 FAM228AQ86W67 206 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EFHBQ8N7U6 833 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 LENG9Q96B70 501 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 DISC1Q9NRI5 854 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 AKT3Q9Y243 479 aa22.94■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PPFIA3O75145 1194 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 IRS1P35568 1242 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 NLRP5P59047 1200 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 FAM189BP81408 668 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 RIT2Q99578 217 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.93■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 MSH4O15457 936 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 GAS7O60861 476 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 OATP04181 439 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 SFNP31947 248 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 CLCN3P51790 818 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 C5orf42Q9H799 3197 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 HOXA2O43364 376 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 NRIP1P48552 1158 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 JAK3P52333 1124 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 RUFY3Q7L099 469 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TLE6Q9H808 572 aa22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 FSD2A1L4K1 749 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EYA4O95677 639 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 LAG3P18627 525 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PRKCEQ02156 737 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 DSC3Q14574 896 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 SLC5A5Q92911 643 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 TLR9Q9NR96 1032 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.9■■□□□ 1.26
ELL3-202ENST00000433927 CPLX1O14810 134 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CHMP2AO43633 222 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ZNF862O60290 1169 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 FGF18O76093 207 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 FGFR1P11362 822 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 COASYQ13057 564 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 RDM1Q8NG50 284 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TBCKQ8TEA7 893 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CLEC1BQ9P126 229 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.89■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 EDIL3O43854 480 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms