RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLCB4Q15147 1175 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC41Q15345 812 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTFR1Q15390 333 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNA10Q16322 511 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PADI6Q6TGC4 694 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNK18Q7Z418 384 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RETREG2Q8NC44 543 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMARCE1Q969G3 411 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRC1Q96MC2 740 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYADML2A6NDP7 307 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNM1LO00429 736 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM13AO94988 1023 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IDEP14735 1019 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMOD1P28289 359 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNM2P50570 870 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC12A3P55017 1021 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGBP1P78318 339 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANO5Q75V66 913 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX12PQ92771 950 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTRQ99707 1265 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EXOC1Q9NV70 894 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NRCAMQ92823 1304 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WWV3 80 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGEB2O15479 319 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJB1P08034 283 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INSRRP14616 1297 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP11B2P19099 503 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUCY2CP25092 1073 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSEN1P49768 467 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACLYP53396 1101 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPEPPSP55786 919 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNOCQ13519 176 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EMC2Q15006 297 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRIK4Q16099 956 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DYMQ7RTS9 669 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOMEZQ8IX15 550 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCP11Q8WWU5 503 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STAMQ92783 540 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIFAP3Q92845 792 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSDMAQ96QA5 445 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP7D2Q96T17 732 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM9Q9C026 710 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OGDHLQ9ULD0 1010 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM150BA6NC51 233 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYMKA6NI61 221 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB39O15060 712 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SGPL1O95470 568 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAP43P17677 238 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP4AP20648 1035 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP2R5AQ15172 486 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 METTL13Q8N6R0 699 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KAT2BQ92831 832 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFT74Q96LB3 600 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 REEP2Q9BRK0 252 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms