RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP3A7	P24462	503 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738		Q4G0T1	1027 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MBOAT7	Q96N66	472 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	IGFLR1	Q9H665	355 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PADI3	Q9ULW8	664 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TECTA	O75443	2155 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	STK36	Q9NRP7	1315 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PFKFB2	O60825	505 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	DGKI	O75912	1065 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	C22orf31	O95567	290 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP1	P03956	469 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM15	Q13444	863 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF135	Q8IUD6	432 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	DISC1	Q9NRI5	854 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CD207	Q9UJ71	328 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF862	O60290	1169 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD10	O75832	226 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CDKL5	O76039	1030 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK1	Q14012	370 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TMX1	Q9H3N1	280 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	GAS7	O60861	476 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX10	O75333	385 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TDP2	O95551	362 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SFN	P31947	248 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PAK2	Q13177	524 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RX5	Q93086	422 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM167A	Q96KS9	214 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMM50	Q9Y512	469 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01565	O15544	149 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CTDNEP1	O95476	244 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	JAK3	P52333	1124 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	AK2	P54819	239 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	EDA	Q92838	391 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	GJA10	Q969M2	543 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEB2	O15479	319 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR32	O75388	356 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	EYA4	O95677	639 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	OAT	P04181	439 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD1	Q15327	319 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	UGCG	Q16739	394 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	RDM1	Q8NG50	284 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP2A	O43633	222 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	MGEA5	O60502	916 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS6KA5	O75582	802 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CSPG5	O95196	566 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGB1	P05556	798 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJB1	P25685	340 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFV1	P49821	464 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKCE	Q02156	737 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	INF2	Q27J81	1249 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	EFHB	Q8N7U6	833 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	GINS2	Q9Y248	185 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	VTN	P04004	478 aa		19.98	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	CLCN3	P51790	818 aa		19.98	■□□□□ 0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79

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