RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.11■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.11■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 HCSTQ9UBK5 93 aa22.11■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 PLXNA3P51805 1871 aa22.11■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 PRR23AA6NEV1 266 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 BRD1O95696 1058 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 FGFR1P11362 822 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 PPM1AP35813 382 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 TMC7Q7Z402 723 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.1■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 HOXA2O43364 376 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 COL1A2P08123 1366 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 DMDP11532 3685 aa22.09■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 REC8O95072 547 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CALM1P0DP23 149 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CALM2P0DP24 149 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CALM3P0DP25 149 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 ARP10275 920 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CEP55Q53EZ4 464 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 ZNF558Q96NG5 402 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 CASD1Q96PB1 797 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 SPG21Q9NZD8 308 aa22.08■■□□□ 1.13
LTB-210ENST00000429299 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 BACH1O14867 736 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MTHFRP42898 656 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 DSC3Q14574 896 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 KIZQ2M2Z5 673 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 FAM228AQ86W67 206 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 POMKQ9H5K3 350 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.07■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 EVPLQ92817 2033 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CCDC69A6NI79 296 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MEIS1O00470 390 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CLCN5P51795 746 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 RNF20Q5VTR2 975 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ABI1Q8IZP0 508 aa22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CACNA1AO00555 2505 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 PRC1O43663 620 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MCTP2Q6DN12 878 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 LRRC43Q8N309 656 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 TMEM87BQ96K49 555 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 OSMRQ99650 979 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZNF302Q9NR11 478 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CDH22Q9UJ99 828 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZNF292O60281 2723 aa22.05■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 GPR32O75388 356 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CCNE2O96020 404 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MCM5P33992 734 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 LIFRP42702 1097 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 RNF19AQ9NV58 838 aa22.04■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 FANCBQ8NB91 859 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 USTQ9Y2C2 406 aa22.03■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LTB-210ENST00000429299 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms