RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428331.6

ATP2C1-204, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C1, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1-204ENST00000428331 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 HOOK2Q96ED9 719 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 DNM1LO00429 736 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 PRR16Q569H4 304 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 MYCT1Q8N699 235 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 FBF1Q8TES7 1133 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 PASKQ96RG2 1323 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC26A4O43511 780 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 PAEPP09466 180 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 CYP11B2P19099 503 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 DRD4P21917 467 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 CHRNA3P32297 505 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 SETDB1Q15047 1291 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 BATF3Q9NR55 127 aa11.65□□□□□ -0.54
ATP2C1-204ENST00000428331 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ASAP2O43150 1006 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PRKCIP41743 596 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 TTLL1O95922 423 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 C5orf60A6NFR6 353 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MEIS1O00470 390 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 C21orf2O43822 256 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 EVI5O60447 810 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM253P0C7T8 217 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 STX2P32856 288 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 SOX5P35711 763 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PTENP60484 403 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 JAMLQ86YT9 394 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MYH3P11055 1940 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 CASZ1Q86V15 1759 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 POTEFA5A3E0 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 POTEIP0CG38 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MYBP10242 640 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 GAP43P17677 238 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 GCKP35557 465 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC29A2Q14542 456 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 POTEGQ6S5H5 508 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MIEF2Q96C03 454 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PGM2Q96G03 612 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.64□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 A0A1W2PRG0 241 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PPFIA2O75334 1257 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ATP6V1G2O95670 118 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 FLT3P36888 993 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 PPP2R5AQ15172 486 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 COL18A1P39060 1754 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 CCT6BQ92526 530 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 GLG1Q92896 1179 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 FAM170AA1A519 330 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 H0YGN5 161 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ZBTB5O15062 677 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 EXOC3O60645 756 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC16A2P36021 539 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 CYP4A11Q02928 519 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ITPK1Q13572 414 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 NFS1Q9Y697 457 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 HIP1RO75146 1068 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 UFL1O94874 794 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 MAPK7Q13164 816 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 WLSQ5T9L3 541 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 VSIG1Q86XK7 387 aa11.63□□□□□ -0.55
ATP2C1-204ENST00000428331 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms