RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM2Q99965 735 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CD320Q9NPF0 282 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CLDND1Q9NY35 253 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CPLX1O14810 134 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF862O60290 1169 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 GAS7O60861 476 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TMOD1P28289 359 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 LTBRP36941 435 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 GJD3Q8N144 294 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 METTL13Q8N6R0 699 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 MBOAT7Q96N66 472 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.7■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD10O75832 226 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 VTNP04004 478 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB1P05556 798 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 FAM189BP81408 668 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCEQ02156 737 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 NPY5RQ15761 445 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 BLIDQ8IZY5 108 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.381e-7■■■■□ 21.5
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 MAP7D2Q96T17 732 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.69■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN3P51790 818 aa23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 DSC3Q14574 896 aa23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB1P25685 340 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 GATMP50440 423 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 UBE3AQ05086 875 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 UGCGQ16739 394 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 AKT3Q9Y243 479 aa23.67■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP2AO43633 222 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 GPR37L1O60883 481 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 POF1BQ8WVV4 589 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 AAASQ9NRG9 546 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.66■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 STK36Q9NRP7 1315 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 CDKL5O76039 1030 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TDP2O95551 362 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 GPC3P51654 580 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.65■■□□□ 1.38
LIMS1-208ENST00000428064 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA2O43364 376 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TBX10O75333 385 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ZP2Q05996 745 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM15Q13444 863 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.64■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 MYO7AQ13402 2215 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 IRS1P35568 1242 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CDC42EP1Q00587 391 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 STK3Q13188 491 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 XKR3Q5GH77 459 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 EFHBQ8N7U6 833 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 GJA10Q969M2 543 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 AIFM3Q96NN9 605 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 CEP89Q96ST8 783 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf42Q9H799 3197 aa23.62■■□□□ 1.37
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