RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MGAT5	Q09328	741 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INF2	Q27J81	1249 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.33	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658		O00370	1275 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC14	Q15048	493 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNGA2	Q16280	664 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PGM2	Q96G03	612 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AZI2	Q9H6S1	392 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMB2	P55268	1798 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXP2	O15409	715 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGA6	P23229	1130 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC1A4	P43007	532 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OXCT1	P55809	520 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.32	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTY	O14607	1347 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RTP1	P59025	263 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OCRL	Q01968	901 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A6NJR5	290 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMED1	Q13445	227 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.31	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPHB6	O15197	1021 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGL2	O15211	777 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LYN	P07948	512 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOXD12	P35452	270 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC6	Q16204	474 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAD21	O60216	631 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6

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