RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 DRP2Q13474 957 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 KIZQ2M2Z5 673 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 XKR9Q5GH70 373 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 ERMNQ8TAM6 284 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 OSMRQ99650 979 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 PPME1Q9Y570 386 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 GPR32O75388 356 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 MED24O75448 989 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 AMHP03971 560 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 PAK2Q13177 524 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 FAM161BQ96MY7 647 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 PADI3Q9ULW8 664 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 SIP14410 1827 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 MYOGP15173 224 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RFC5P40937 340 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 PRPHP41219 470 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 DNM2P50570 870 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RAB34Q9BZG1 259 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 A0A087WWV3 80 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RPS6KA5O75582 802 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RPA1P27694 616 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 GPC3P51654 580 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 PDIA5Q14554 519 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 IL17AQ16552 155 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SCLT1Q96NL6 688 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 MTMR6Q9Y217 621 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 STX6O43752 255 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 TLL1O43897 1013 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RESTQ13127 1097 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 NLRP7Q8WX94 980 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ENPP3O14638 875 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 GPR182O15218 404 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 GJB5O95377 273 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RARRES1P49788 294 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 CDC42EP1Q00587 391 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 EMC2Q15006 297 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ODR4Q5SWX8 454 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 POTEGQ6S5H5 508 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 FAM228AQ86W67 206 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 TMEM143Q96AN5 459 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 NACC1Q96RE7 527 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 TMX1Q9H3N1 280 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 ZNF576Q9H609 170 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 STK24Q9Y6E0 443 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 EVPLQ92817 2033 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SZT2Q5T011 3432 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 PP2D1A8MPX8 630 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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