RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 HDXQ7Z353 690 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ERO1BQ86YB8 467 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 KIRREL1Q96J84 757 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TOX2Q96NM4 488 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJC7Q99615 494 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 EPN3Q9H201 632 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 IFT57Q9NWB7 429 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PRR33A8MZF0 331 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GFRA2O00451 464 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TAF5LO75529 589 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN15O95858 294 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FLT3LGP49771 235 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CACNB3P54284 484 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PPIL2Q13356 520 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 C2orf27AQ580R0 203 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MFSD4AQ8N468 514 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FAM122AQ96E09 287 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GUCD1Q96NT3 240 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FEZ1Q99689 392 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1B0GUL6 1792 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MYH13Q9UKX3 1938 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CYP2C8P10632 490 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GDNFP39905 211 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CAP2P40123 477 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CHRNDQ07001 517 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 NCAPHQ15003 741 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TCEA2Q15560 299 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 DCAF15Q66K64 600 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 LILRB2Q8N423 598 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC120Q96HB5 630 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GPATCH3Q96I76 525 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TEPSINQ96N21 525 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MIPEPQ99797 713 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FBRSQ9HAH7 460 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 FANCLQ9NW38 375 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PLAAQ9Y263 795 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PTPRFP10586 1907 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 H3BS24 57 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CHL1O00533 1208 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 HTR3BO95264 441 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 HOXB7P09629 217 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PLCG1P19174 1290 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GUCY2CP25092 1073 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CFPP27918 469 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 PDE4BQ07343 736 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MTERF2Q49AM1 385 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC181Q5TID7 509 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-210ENST00000415055 COA7Q96BR5 231 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms