RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
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RNU6-1199P-201ENST00000411249 DGKDQ16760 1214 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.03□□□□□ -1.92
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