RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 POLLQ9UGP5 575 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 BCS1LQ9Y276 419 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0U1RQJ8 604 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PJA2O43164 708 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RXRAP19793 462 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 LMNB2Q03252 620 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 EPSTI1Q96J88 318 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 VPS33BQ9H267 617 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SH2D4AQ9H788 454 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 BATF3Q9NR55 127 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 CYP7A1P22680 504 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 AMPD3Q01432 767 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SATB1Q01826 763 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf54Q08AI8 447 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 WDR59Q6PJI9 974 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 CCDC114Q96M63 670 aa7.88□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 GDF3Q9NR23 364 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MCM8Q9UJA3 840 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SIAH2O43255 324 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RASSF9O75901 435 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RHOBTB3O94955 611 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MYZAPP0CAP1 466 aa7.87□□□□□ -1.15
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CTPS1-201ENST00000372616 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CROCCP2Q86T23 111 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 IQCA1Q86XH1 822 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TEX11Q8IYF3 940 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CRELD1Q96HD1 420 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SGSM3Q96HU1 749 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 AK8Q96MA6 479 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PIM2Q9P1W9 311 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GGT7Q9UJ14 662 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.87□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SRGAP2O75044 1071 aa7.86□□□□□ -1.15
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