RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMNL2Q96PY5 1086 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT8AQ9H1J5 351 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTMQ9P121 344 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO10Q9UK96 956 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABRDO14764 452 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUAK1O60285 661 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-CO1P00395 513 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KNG1P01042 644 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBL2P10244 700 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF28P17035 718 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENPP1P22413 925 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAR1P56945 870 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD83Q01151 205 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAP1Q01518 475 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCD1Q15116 288 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWA3BQ502W6 1294 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO3Q9BYT9 981 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTG2Q9H4K7 406 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHTN1A0MZ66 631 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS38A1L453 326 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALDH1L1O75891 902 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH8O95206 1070 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFBP00751 764 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFKMP08237 780 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL6A1P12109 1028 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL13P35225 146 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK2P51955 445 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPARAQ07869 468 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOGSQ13724 837 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF124Q15973 351 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT8Q16880 541 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR31Q5SQ13 230 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CIAPIN1Q6FI81 312 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMIPQ8IY22 773 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0A6YYJ9 748 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JNJ9 132 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3D21A4FU49 640 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 FFAR3O14843 346 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUTAO60888 179 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 OPHN1O60890 802 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGCRP04035 888 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTHFD2P13995 350 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLD1P28340 1107 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXKP42681 527 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETV4P43268 484 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 SARSP49591 514 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPIDRQ14159 915 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLUL1Q15846 466 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGKDQ16760 1214 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN21Q16825 1174 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 INAVAQ3KP66 663 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT83Q5H943 113 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCERG1LQ5VWI1 586 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms