RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NKX3-2P78367 333 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 STK4Q13043 487 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 PARVGQ9HBI0 331 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 MSCO60682 206 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 KPNA6O60684 536 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS4O75173 837 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 CAVIN2O95810 425 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 F2P00734 622 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 GAP43P17677 238 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 RFC5P40937 340 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 MAPK7Q13164 816 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 DAW1Q8N136 415 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 MYCT1Q8N699 235 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 KAT2BQ92831 832 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 DACH1Q9UI36 760 aa24.53■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ZEB2O60315 1214 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 INSRRP14616 1297 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ZNF165P49910 485 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ZNF131P52739 623 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 DRC1Q96MC2 740 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-201ENST00000312060 LBX1P52954 281 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 EMC2Q15006 297 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SFR1Q86XK3 245 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.51■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CHMP4BP1P59074 171 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 RBSNQ9H1K0 784 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PRCPP42785 496 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PSEN2P49810 448 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SOX10P56693 466 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 RNF214Q8ND24 703 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KIFAP3Q92845 792 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 COL1A2P08123 1366 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 IGBP1P78318 339 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 STIM1Q13586 685 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MFSD10Q14728 455 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 ODR4Q5SWX8 454 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 HAS3O00219 553 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PLS3P13797 630 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PPFIA1Q13136 1202 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 LHX8Q68G74 356 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 RNF180Q86T96 592 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 32.8
CTU2-201ENST00000312060 CBX8Q9HC52 389 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R2P41236 205 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 LRRC41Q15345 812 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KCNA10Q16322 511 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 ADSSL1Q8N142 457 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 TMEM143Q96AN5 459 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.47■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.47■■□□□ 1.51
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