RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 ERICH1Q86X53 443 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ZMYND12Q9H0C1 365 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 STXBP2Q15833 593 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ESYT3A0FGR9 886 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RPS6KA2Q15349 733 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SURF1Q15526 300 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CLDN3O15551 220 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 MSH2P43246 934 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF543Q08ER8 600 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 PRPSAP2O60256 369 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ACSL3O95573 720 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ARL4AP40617 200 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 MYO1EQ12965 1108 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RGL1Q9NZL6 768 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 LRRC4Q9HBW1 653 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ADSSL1Q8N142 457 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CFAP61Q8NHU2 1237 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CPP00450 1065 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CCZ1BP86790 482 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 PDIA5Q14554 519 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 HEMGNQ9BXL5 484 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 A0A1B0GTH6 734 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GPC5P78333 572 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 PASD1Q8IV76 773 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CFAP57Q96MR6 1250 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SCINQ9Y6U3 715 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 DPYDQ12882 1025 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM270Q6UE05 265 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RSPH3Q86UC2 560 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 STK4Q13043 487 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 LDHDQ86WU2 507 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 SAAL1Q96ER3 474 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 CHP1Q99653 195 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 PLAAQ9Y263 795 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD3-201ENST00000308580 RASA1P20936 1047 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CHRNA5P30532 468 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 VAMP7P51809 220 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CEP55Q53EZ4 464 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZWILCHQ9H900 591 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 KIF22Q14807 665 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CDO1Q16878 200 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.65□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SEMA3FQ13275 785 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MAPK6Q16659 721 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 FBXO40Q9UH90 709 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 OATP04181 439 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SESN3P58005 492 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TERF2Q15554 542 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MT-ND3P03897 115 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms