RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF20AO95235 890 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MED15Q96RN5 788 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 ODR4Q5SWX8 454 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.93■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.93■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 A6NJR5 290 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 C1QTNF8P60827 252 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 TRPV1Q8NER1 839 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 RAET1EQ8TD07 263 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 RFC5P40937 340 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CPT1AP50416 773 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCB2Q00722 1185 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RX5Q93086 422 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY3O60266 1144 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HBP1O60381 514 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 PLS3P13797 630 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ELNP15502 786 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CCNE1P24864 410 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCLQ9NW38 375 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 GCNT3O95395 438 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGCRP04035 888 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CNGA1P29973 690 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP5P51878 434 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP89Q96ST8 783 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BRB1 525 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT4O43236 478 aa22.89■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 PRMT2P55345 433 aa22.89■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 CENPPQ6IPU0 288 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 FIZ1Q96SL8 496 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TSKSQ9UJT2 592 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MYBP10242 640 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RTP1P59025 263 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC63Q05C16 580 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TTI2Q6NXR4 508 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE4BO95155 1302 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PEX3P56589 373 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TSG101Q99816 390 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 K7ENM7 598 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RARBP10826 455 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SMTNP53814 917 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ALCAMQ13740 583 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.87■■□□□ 1.25
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