RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ARID2Q68CP9 1835 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MAFO75444 373 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 LYPLA2O95372 231 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MYOGP15173 224 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CEP170P1Q96L14 293 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PPME1Q9Y570 386 aa27.94■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 LAD1O00515 517 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 GPR32O75388 356 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 AMHP03971 560 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SYT1P21579 422 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PAK2Q13177 524 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MYOCDQ8IZQ8 938 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 OSMRQ99650 979 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SEMA6BQ9H3T3 888 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.93■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB39O15060 712 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 DNM2P50570 870 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 BRAPQ7Z569 592 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PADI3Q9ULW8 664 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TLL1O43897 1013 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 DRP2Q13474 957 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 XKR9Q5GH70 373 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 FAM117BQ6P1L5 589 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 FERMT3Q86UX7 667 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ERMNQ8TAM6 284 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SLC7A3Q8WY07 619 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 TUFT1Q9NNX1 390 aa27.91■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 RFC5P40937 340 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PRPHP41219 470 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 PDIA5Q14554 519 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SCLT1Q96NL6 688 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF576Q9H609 170 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ANKEF1Q9NU02 776 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MED24O75448 989 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 RPS6KA5O75582 802 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 GJB5O95377 273 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CA3P07451 260 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 GPC3P51654 580 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CDC42EP1Q00587 391 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 RAB34Q9BZG1 259 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 ENPP3O14638 875 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 RPA1P27694 616 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 GUCD1Q96NT3 240 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 A0A087WWV3 80 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 UPP2O95045 317 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 IL17AQ16552 155 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 ODR4Q5SWX8 454 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 PIGOQ8TEQ8 1089 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP7Q8WX94 980 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 TOP1MTQ969P6 601 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 RAD9AQ99638 391 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 GPR182O15218 404 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CXCL2-201ENST00000296031 EMC2Q15006 297 aa27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms