RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CLCN3P51790 818 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ADAM15Q13444 863 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAM228AQ86W67 206 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 POF1BQ8WVV4 589 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAM122AQ96E09 287 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAM167AQ96KS9 214 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.19■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 MSH4O15457 936 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEB2O15479 319 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 MBTPS2O43462 519 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 EDIL3O43854 480 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ALADP13716 330 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 USP11P51784 963 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 NLRP5P59047 1200 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 RUFY3Q7L099 469 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 DISC1Q9NRI5 854 aa22.18■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 MAP7D2Q96T17 732 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 AAASQ9NRG9 546 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 AKT3Q9Y243 479 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 WDR81Q562E7 1941 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.17■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP2AO43633 222 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF862O60290 1169 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 GAS7O60861 476 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 OATP04181 439 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFV1P49821 464 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SLC5A5Q92911 643 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 RIT2Q99578 217 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 CD207Q9UJ71 328 aa22.16■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PRR33A8MZF0 331 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TMOD1P28289 359 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 NRIP1P48552 1158 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAM189BP81408 668 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PRKCEQ02156 737 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 DSC3Q14574 896 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 EFHBQ8N7U6 833 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TBCKQ8TEA7 893 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 GJA10Q969M2 543 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 HCSTQ9UBK5 93 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.15■■□□□ 1.14
CXCL3-201ENST00000296026 DCXO43602 365 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 FGFR1P11362 822 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 SFNP31947 248 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 JAK3P52333 1124 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 UGCGQ16739 394 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.14■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CPLX1O14810 134 aa22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 UBE3AQ05086 875 aa22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC1BQ9P126 229 aa22.13■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 PSMD10O75832 226 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 FGF18O76093 207 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 DEXIO95424 95 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 Q4G0T1 1027 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CWH43Q9H720 699 aa22.12■■□□□ 1.13
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