RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 NFIBO00712 420 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 WNT10BO00744 389 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 KCND2Q9NZV8 630 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 CYP2J2P51589 502 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 JAM2P57087 298 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 FAM71BQ8TC56 605 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 RIT2Q99578 217 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 HIP1RO75146 1068 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 PRKCIP41743 596 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 SLC7A5Q01650 507 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 CXCL9Q07325 125 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 IL31RAQ8NI17 732 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.02■□□□□ 0.96
USP21-201ENST00000289865 MAP3K10Q02779 954 aa21.02■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 EXOC4Q96A65 974 aa21.02■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.02■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 NAGPAQ9UK23 515 aa21.02■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 RPTORQ8N122 1335 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PHACTR2O75167 634 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 GUCY2CP25092 1073 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CPXCR1Q8N123 301 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 RUBCNQ92622 972 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 VPS33BQ9H267 617 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MED4Q9NPJ6 270 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.01■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 FLOT1O75955 427 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 NEK9Q8TD19 979 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 DMAC2Q9NW81 257 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 RNF14Q9UBS8 474 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PHF20L1A8MW92 1017 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 BCRP11274 1271 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 ALAS1P13196 640 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 FMO5P49326 533 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MAPK7Q13164 816 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 RASA3Q14644 834 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PLS1Q14651 629 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 C8orf74Q6P047 294 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PADI6Q6TGC4 694 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MAEAQ7L5Y9 396 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 DAW1Q8N136 415 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 HOMER2Q9NSB8 354 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 STIM2Q9P246 746 aa21■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 GFPT2O94808 682 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 TRIM49P0CI25 452 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 TRIM49CP0CI26 452 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 DGKZQ13574 1117 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CCDC66A2RUB6 948 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 K7ENM7 598 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 ANXA13P27216 316 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 LMAN1P49257 510 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 TNIP1Q15025 636 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 VPS36Q86VN1 386 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.99■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 FERP16591 822 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 STAT1P42224 750 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 TKFCQ3LXA3 575 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CBWD6Q4V339 395 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 NENFQ9UMX5 172 aa20.98■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 PPP1R37O75864 691 aa20.97■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP21-201ENST00000289865 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms