RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GNGT2O14610 69 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CASP2P42575 452 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TXNRD1Q16881 649 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PRR29P0C7W0 189 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 BARHL2Q9NY43 387 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KRT38O76015 456 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GH2P01242 217 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 UTYO14607 1347 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 E9PMD0 336 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PHEXP78562 749 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PADI6Q6TGC4 694 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MORC4Q8TE76 937 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 COPEO14579 308 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CALB1P05937 261 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GYS2P54840 703 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 VPS39Q96JC1 886 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RASA4BC9J798 803 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RASA4O43374 803 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RAD17O75943 681 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RFX1P22670 979 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FAF2Q96CS3 445 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF3Q9H094 633 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZWILCHQ9H900 591 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.64■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 WDR64B1ANS9 1081 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA4O75676 772 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KRT80Q6KB66 452 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SHC4Q6S5L8 630 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TEX33O43247 280 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA3P32297 505 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KLC3Q6P597 504 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GCLMP48507 274 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR1Q13613 665 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FAM167AQ96KS9 214 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FAM187AA6NFU0 413 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ6P48051 423 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P54278 862 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS15P98073 1019 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KRT76Q01546 638 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KCNB1Q14721 858 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 WDR70Q9NW82 654 aa22.62■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KRT10P13645 584 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R2AP63151 447 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC138Q96M89 665 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GMNCA6NCL1 334 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CHUKO15111 745 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 IL1RL1Q01638 556 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PREX2Q70Z35 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP27XA6NNY8 438 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L15C9J2P7 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L11C9JVI0 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L18D6R9N7 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L22D6RA61 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L19D6RCP7 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L20D6RJB6 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN3O15551 220 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms