RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K14Q99558 947 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.89□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ORC4O43929 436 aa7.88□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 ZBED4O75132 1171 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BAIAP3O94812 1187 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB10O96000 172 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 AVPP01185 164 aa7.88□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 CALML3P27482 149 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF5BP33176 963 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC10P48553 1259 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAQP50148 359 aa7.88□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 HIC1Q14526 733 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 POSTNQ15063 836 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SHC4Q6S5L8 630 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF135Q8IUD6 432 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP11Q96EK4 314 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDND1Q9NY35 253 aa7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM221A6NGB7 291 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R296 226 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BIN1O00499 593 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP2A1O14983 1001 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CSPG5O95196 566 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GJB5O95377 273 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TPM1P09493 284 aa7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 RXRAP19793 462 aa7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 TXLNAP40222 546 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 SEC23AQ15436 765 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SBK1Q52WX2 424 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BANK1Q8NDB2 785 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST13Q8NET6 341 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.87□□□□□ -1.15
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SMARCE1-201ENST00000264640 NOD1Q9Y239 953 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM50BQ9Y247 325 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DMDP11532 3685 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB14A6NK59 587 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD18B2RXH4 712 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 F5H6K3 240 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FGRP09769 529 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 KLRC3Q07444 240 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXC1Q12948 553 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA3FQ13275 785 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 BFSP2Q13515 415 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 PNOCQ13519 176 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.86□□□□□ -1.15
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