RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262315.13

CHTF18-201, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHTF18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-201ENST00000262315 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 AK8Q96MA6 479 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 A0A1W2PQC6 194 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 LAD1O00515 517 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 IVLP07476 585 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 CNTN2Q02246 1040 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 CYP4A11Q02928 519 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 MAGEA9P43362 315 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 OAZ1P54368 228 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 FSTL1Q12841 308 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 VWA3BQ502W6 1294 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 L1RE1Q9UN81 338 aa14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CHTF18-201ENST00000262315 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FECHP22830 423 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 KIF11P52732 1056 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 KCTD2Q14681 263 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CAPNS2Q96L46 248 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.58□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 POTEFA5A3E0 1075 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 POTEGQ6S5H5 508 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 IL31RAQ8NI17 732 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MTMR9Q96QG7 549 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PNMA2Q9UL42 364 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PTPRFP10586 1907 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SORBS3O60504 671 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 APLP1P51693 650 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 RAD54LQ92698 747 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 POTEB2H3BUK9 544 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 LRRC31Q6UY01 552 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 UNC13DQ70J99 1090 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 HAS1Q92839 578 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MS4A14Q96JA4 679 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PANK4Q9NVE7 773 aa14.57□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM86B1E9PN63 330 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PIK3CDO00329 1044 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CNMDO75829 334 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 GUCY2CP25092 1073 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CCNA1P78396 465 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SREBF2Q12772 1141 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 COASYQ13057 564 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 IFNL1Q8IU54 200 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SFI1A8K8P3 1242 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SREBF1P36956 1147 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MAGEA1P43355 309 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 HSD17B4P51659 736 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 GPBP1Q86WP2 473 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CHST13Q8NET6 341 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 RAB34Q9BZG1 259 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FBXO40Q9UH90 709 aa14.56□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CHMP2AO43633 222 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CENPPQ6IPU0 288 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MMP19Q99542 508 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 ATP2A1O14983 1001 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FTCDO95954 541 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 VAV2P52735 878 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 SP4Q02446 784 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MEA1Q16626 185 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CUEDC2Q9H467 287 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MYH10P35580 1976 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 ACTN1P12814 892 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 PSMC6P62333 389 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 NOGQ13253 232 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 MAN2A1Q16706 1144 aa14.55□□□□□ -0.08
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC181Q5TID7 509 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms