RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.03■■■□□ 2.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNF180Q86T96 592 aa28.96■■■□□ 2.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.95■■■□□ 2.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.95■■■□□ 2.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIS1O00470 390 aa28.94■■■□□ 2.22
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