RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 O00370 1275 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CREB1P16220 341 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CALB2P22676 271 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 MGAT5Q09328 741 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SOGA3Q5TF21 947 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PEX11AO75192 247 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RNF8O76064 485 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ALDH3A1P30838 453 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 HES6Q96HZ4 224 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FAM210AQ96ND0 272 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TRIM7Q9C029 511 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 USP17L12C9JPN9 530 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 USP17L21D6R901 530 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RASGRF2O14827 1237 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RNF220Q5VTB9 566 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RGL1Q9NZL6 768 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 UNC5CO95185 931 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FGRP09769 529 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CNGA1P29973 690 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CHRNA2Q15822 529 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 BARGINQ6ZT62 677 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 JAMLQ86YT9 394 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PROM2Q8N271 834 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TPBGLP0DKB5 382 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GM2AP17900 193 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RFC5P40937 340 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TMEM120BA0PK00 339 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ABLIM1O14639 778 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 EPS15P42566 896 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GDAP1Q8TB36 358 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DDX12PQ92771 950 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PNMA5Q96PV4 448 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TXKP42681 527 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 KLC1Q07866 573 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 STK32AQ8WU08 396 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TRIM4Q9C037 500 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 H0Y3Z8 333 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PEX5P50542 639 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 AMFRQ9UKV5 643 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 MTMR7Q9Y216 660 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FAM170AA1A519 330 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CGB2Q6NT52 195 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 BRINP3Q76B58 766 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 RIPK2O43353 540 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 LONP2Q86WA8 852 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TMEM237Q96Q45 408 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GH1P01241 217 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 H2AFZP0C0S5 128 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SLC9A1P19634 815 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 POLE2P56282 527 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 H2AFVQ71UI9 128 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.95■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms