RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231526.8

TRAPPC13-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC13, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13-201ENST00000231526 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 HYIQ5T013 277 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 ADSSL1Q8N142 457 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 RMDN3Q96TC7 470 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 IER2Q9BTL4 223 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 RNF146Q9NTX7 359 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 RGL1Q9NZL6 768 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.96□□□□□ -1.46
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TRAPPC13-201ENST00000231526 DNM3Q9UQ16 869 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 EML1O00423 815 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PDGFRBP09619 1106 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SKILP12757 684 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PSMC6P62333 389 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PTK7Q13308 1070 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 FILIP1LQ4L180 1135 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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TRAPPC13-201ENST00000231526 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 GPBP1Q86WP2 473 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TPH2Q8IWU9 490 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 C12orf42Q96LP6 360 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TAAR1Q96RJ0 339 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 VPS16Q9H269 839 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SAMM50Q9Y512 469 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 GLTPD2A6NH11 291 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 N4BP3O15049 544 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TPM2P07951 284 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 ITGB5P18084 799 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPAG1Q07617 926 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CBLBQ13191 982 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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TRAPPC13-201ENST00000231526 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 MOB2Q70IA6 237 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 IL31RAQ8NI17 732 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TEX13BQ9BXU2 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 ELP3Q9H9T3 547 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PANK4Q9NVE7 773 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 INTS13Q9NVM9 706 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 VAV3Q9UKW4 847 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 A0A1B0GTH6 734 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 SFI1A8K8P3 1242 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KCNJ18B7U540 433 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TEX33O43247 280 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PSMD10O75832 226 aa5.95□□□□□ -1.46
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TRAPPC13-201ENST00000231526 FLT3P36888 993 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 GNALP38405 381 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PPP1R2P41236 205 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 COASYQ13057 564 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 MTMR1Q13613 665 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KCNJ12Q14500 433 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 PGM5Q15124 567 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 KRT31Q15323 416 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 VSTM4Q8IW00 320 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 P2RX5Q93086 422 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 DNAJC19Q96DA6 116 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC13-201ENST00000231526 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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