RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Map3k7clP58500 142 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrch2Q3UMG5 773 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam198bQ3UPI1 517 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnga4Q3UW12 575 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syne3Q4FZC9 975 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Magea3Q6T340 320 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TbckQ8BM85 762 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PccaQ91ZA3 724 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gadd45gQ9Z111 159 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sema4dO09126 861 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trappc12Q8K2L8 797 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bud13Q8R149 637 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CpzQ8R4V4 654 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ranbp17Q99NF8 1088 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cog1Q9Z160 980 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 LtbrP50284 415 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stx2Q00262 289 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Impg2Q80XH2 1243 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem60Q8K174 133 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Akt3Q9WUA6 479 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tsta3P23591 321 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trim42Q9D2H5 723 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rsph3bQ9DA80 389 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyth1Q9QX11 398 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abhd2Q9QXM0 425 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mdc1Q5PSV9 1707 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cep85lA0A1W2P884 806 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm21962L7N280 338 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PltpP55065 493 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lmntd2Q0VET5 664 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 E2f8Q58FA4 860 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankrd6Q69ZU8 712 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lca5Q80ST9 704 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gimap4Q99JY3 219 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 KynuQ9CXF0 464 aa18.14■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Foxd4Q60688 444 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Llgl1Q80Y17 1036 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cabs1Q8C633 391 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8K2W9 541 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dach1Q9QYB2 751 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc175E9PVB3 822 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rhbdl3P58873 404 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Irx2P81066 474 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mageb16Q9CWV4 363 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spata17Q9D552 379 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Krt36B1AQ75 473 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aoc3O70423 765 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HelqQ2VPA6 1069 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Usp17leQ7M764 540 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fsd1lQ8BYN5 507 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr27Q8C5V5 780 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 C8aQ8K182 587 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ror2Q9Z138 944 aa18.13■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 JrklB2RRL2 523 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ugt1a8D3Z748 530 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ugt1a10E9PXN7 530 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gap43P06837 227 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd72P21855 354 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm14685Q52KH6 695 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myo19Q5SV80 963 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Med7Q9CZB6 233 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klra10Q9R1G6 266 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfyve9A2A8R0 1397 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10134F6ZQC6 126 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Per2O54943 1257 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AgtP11859 477 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttf2Q5NC05 1138 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ItgaeQ60677 1167 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nup62clA2AG10 272 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trappc11B2RXC1 1133 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina3iD3Z450 408 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nub1P54729 614 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tspan17Q9D7W4 270 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5134E9QAB5 671 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmd14O35593 310 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MagohP61327 146 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp2e1Q05421 493 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Llgl2Q3TJ91 1027 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5622Q810Q0 167 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prpsap2Q8R574 369 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MagohbQ9CQL1 146 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms