RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Surf1P09925 306 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnni3P48787 211 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Capn13Q3UW68 665 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 HyiQ8R1F5 277 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Wrap53Q8VC51 532 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr1494Q8VGP8 315 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr395Q8VGR3 312 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MymkQ9D1N4 221 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mss51Q9D5Z5 446 aa13.11□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hoxb13P70321 286 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nfe2Q07279 373 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tcf12Q61286 706 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 LbpQ61805 481 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 C6.1alQ7M757 291 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 VcpkmtQ8C436 228 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Lrrc41Q8K1C9 807 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc14a1Q8VHL0 384 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tacc2Q9JJG0 1149 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm4307E9PZY4 289 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm4312K9J7E2 289 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Exoc4O35382 975 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MycP01108 439 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Glud1P26443 558 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pi4kbQ8BKC8 816 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rbm41Q8JZV4 413 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nup210lQ9D2F7 1881 aa13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Svs3aF2Z472 265 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Btbd1P58544 488 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CiitaP79621 1155 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Snx27Q3UHD6 539 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nudt16Q6P3D0 195 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Q9CYI0 393 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fut2Q9JL27 347 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hs6st3Q9QYK4 470 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adamts9E9PUN6 1931 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn2r79E9Q067 851 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Heatr4E9Q357 955 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Abcb4P21440 1276 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gja8P28236 440 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmod1P49813 359 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 SqleP52019 572 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Samsn1P57725 372 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fads2p1Q0VAX3 487 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ric8aQ3TIR3 530 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mief2Q5NCS9 454 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PodnQ7TQ62 611 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Defb19Q8K3I8 83 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bud13Q8R149 637 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ears2Q9CXJ1 523 aa13.09□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cfap73J3QPZ5 306 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Usp25P57080 1055 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam49aQ8BHZ0 323 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Setdb2Q8C267 713 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mettl24Q8CCB5 363 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adcy3Q8VHH7 1145 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Drc3Q9D5E4 523 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Serpinb12Q9D7P9 423 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Akt3Q9WUA6 479 aa13.08□□□□□ -0.31
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mdm4O35618 489 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rnaseh1O70338 285 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tap2P36371 702 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sycp1Q62209 993 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 F13a1Q8BH61 732 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gjc2Q8BQU6 440 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dmtf1Q8CE22 761 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Upb1Q8VC97 393 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Filip1Q9CS72 1211 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Efhd1Q9D4J1 240 aa13.08□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankrd16A2AS55 361 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trim12cD3Z3L3 497 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ptpn11P35235 597 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Spata7Q80VP2 582 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Spata32Q8C5V0 334 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc15a5Q8CBB2 566 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vopp1Q8R1C3 172 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tex21Q9R0U9 575 aa13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tll2Q9WVM6 1012 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms