RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BrdtQ91Y44 956 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HlcsQ920N2 722 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pls3Q99K51 630 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grtp1Q9D3N8 359 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpap3Q9D706 660 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam217aQ9D9W6 419 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 March8Q9DBD2 286 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PycardQ9EPB4 193 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmod4Q9JLH8 345 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chaf1aQ9QWF0 911 aa10.14□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kmt2eQ3UG20 1868 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A286YCQ6 122 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dmrta2A2A9A2 531 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc78D3Z5T1 437 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 OgdhlE9Q7L0 1029 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm1758F6VZZ1 202 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TazI7HJS2 263 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fzd1O70421 642 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scp2P32020 547 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stat4P42228 749 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gng11P61953 73 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taf3Q5HZG4 932 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r13bQ62415 1087 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp91Q62511 572 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nsun6Q7TS68 476 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd24Q80VM7 985 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc45a1Q8BIV7 751 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc26Q8BS45 554 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hook3Q8BUK6 718 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc41Q8K1C9 807 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp33Q8R5K2 909 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Erp44Q9D1Q6 406 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps33aQ9D2N9 598 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap53Q9D439 514 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rilpl1Q9JJC6 406 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plod3Q9R0E1 741 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pex11aQ9Z211 246 aa10.13□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dhtkd1A2ATU0 921 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnh2O35219 1162 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RaraP11416 462 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Epb41l4aP52963 686 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gtf2bP62915 316 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vgll3P85442 326 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnma1Q08460 1209 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fads2p1Q0VAX3 487 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3414Q3TNU4 584 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc16a10Q3U9N9 512 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a13Q3UHK1 637 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf207Q3V3A7 635 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scarf1Q5ND28 820 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cct6bQ61390 531 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf280dQ68FE8 974 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ShbQ6PD21 503 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf516Q7TSH3 1157 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acad11Q80XL6 779 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf784Q8BI69 297 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr180Q8BPS4 441 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SucoQ8C341 1250 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rassf4Q8CB96 322 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cbwd1Q8VEH6 393 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Calml4Q91WQ9 153 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps36Q91XD6 386 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ranbp17Q99NF8 1088 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lpin2Q99PI5 893 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbx18Q9EPZ6 613 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx25Q9QY15 484 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phtf1Q9QZ09 761 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syt5Q9R0N5 386 aa10.12□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HttP42859 3119 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oip5A2AQ14 241 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spocd1B1ASB6 936 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ugt1a8D3Z748 530 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ugt1a10E9PXN7 530 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PurbO35295 324 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajb6O54946 365 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EpoP07321 192 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifnar1P33896 590 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akr1b1P45376 316 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts10P58459 1104 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcna2P63141 499 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm1587Q3UT80 123 aa10.11□□□□□ -0.79
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oog4Q4G0C7 502 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms