RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	WHAMM	Q8TF30	809 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKS1A	Q92625	1134 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC17	Q96LX7	622 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB39	O15060	712 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP11B2	P19099	503 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	DR1	Q01658	176 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MDM1	Q8TC05	714 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF14	Q9UBS8	474 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGA4	P13612	1032 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP63	Q96MT8	703 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF653	Q96CK0	615 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EVI5	O60447	810 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	LSP1	P33241	339 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ADCY8	P40145	1251 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ1	P48048	391 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ICE2	Q659A1	982 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	GDAP1	Q8TB36	358 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PBK	Q96KB5	322 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SWAP70	Q9UH65	585 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R37	O75864	691 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	LMNB1	P20700	586 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ECM1	Q16610	540 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRP14	Q86W24	1093 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP5	P51878	434 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PEX3	P56589	373 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NAB2	Q15742	525 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MEA1	Q16626	185 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SYNC	Q9H7C4	482 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525		A6NNZ2	444 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP2K2	P36507	400 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	DLGAP5	Q15398	846 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	AKAP3	O75969	853 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	STAT2	P52630	851 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SMTN	P53814	917 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SAAL1	Q96ER3	474 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC77	Q9BR77	488 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NAGPA	Q9UK23	515 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQJ5	194 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525		H0YIN7	160 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	MMP10	P09238	476 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP4C	P60510	307 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	C2CD6	Q53TS8	623 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPIN3-223	ENST00000639525	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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