RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FGFR4	P22455	802 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KLRC1	P26715	233 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PROM2	Q8N271	834 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RILP	Q96NA2	401 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31	3e-7	■■□□□ 14.4
PXN-222	ENST00000637624	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MAPK13	O15264	365 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FER	P16591	822 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ADRA2B	P18089	450 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MCAM	P43121	646 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	STRN3	Q13033	797 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GFPT2	O94808	682 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DES	P17661	470 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KCNA3	P22001	575 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LPIN2	Q92539	896 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	IFNB1	P01574	187 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CA4	P22748	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	NR2F2	P24468	414 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CTSW	P56202	376 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TFAP4	Q01664	338 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	NFIX	Q14938	502 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LGR5	O75473	907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	STK4	Q13043	487 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TTC1	Q99614	292 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GYG2	O15488	501 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SERPINB2	P05120	415 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	COPS2	P61201	443 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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