RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635835.1

CACNB4-215, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, humanhuman

TSL 5

Gene CACNB4, Length 1,807 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4-215ENST00000635835 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TRIM64BA6NI03 449 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 OR5K4A6NMS3 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CENPBD1B2RD01 187 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ADAM23O75077 832 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CRYZL1O95825 349 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GNA11P29992 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 MSH2P43246 934 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ATP1A2P50993 1020 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 OCRLQ01968 901 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 MOGQ16653 247 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 EMBQ6PCB8 327 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ITIH5Q86UX2 942 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CCNJLQ8IV13 435 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 FBXO41Q8TF61 875 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CAVIN3Q969G5 261 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ZNF333Q96JL9 665 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 FAM20AQ96MK3 541 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CTRCQ99895 268 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 VPS16Q9H269 839 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 IQGAP2Q13576 1575 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 YEATS4O95619 227 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TMOD1P28289 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 NR2C2P49116 596 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TBX4P57082 545 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 IGBP1P78318 339 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 POU5F1BQ06416 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 RUNX1T1Q06455 604 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CDK18Q07002 472 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CETN1Q12798 172 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 Q3C1V9 767 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 KLHL35Q6PF15 583 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GALNT7Q86SF2 657 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 BBOF1Q8ND07 529 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 STK32AQ8WU08 396 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 NRBF2Q96F24 287 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 TMEM87BQ96K49 555 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PLAAQ9Y263 795 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 JCADQ9P266 1359 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 AFF2P51816 1311 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SSH2Q76I76 1423 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SNTNA6NMZ2 147 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SYCE1LA8MT33 242 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ATP9AO75110 1047 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 GUCY1B2O75343 617 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 KRT6AP02538 564 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 KRT6BP04259 564 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CASP14P31944 242 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 EVI2BP34910 448 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PHBP35232 272 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CDK7P50613 346 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 RAD23BP54727 409 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 NCALDP61601 193 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PFKPQ01813 784 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 DNAJC3Q13217 504 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 PSMD6Q15008 389 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 STK11Q15831 433 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNB4-215ENST00000635835 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms