RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624412.3

CU633967.1-208, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CU633967.1, Length 944 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-208ENST00000624412 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.01□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EVPLQ92817 2033 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EML1O00423 815 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PFKMP08237 780 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 CKBP12277 381 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 THPOP40225 353 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TXKP42681 527 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PSMC5P62195 406 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ADAM17P78536 824 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TMEM266Q2M3C6 531 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZNF484Q5JVG2 852 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MARCH8Q5T0T0 291 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RSPH3Q86UC2 560 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MTMR9Q96QG7 549 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TMEM60Q9H2L4 133 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 IL23AQ9NPF7 189 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PCDHA12Q9UN75 941 aa10□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 LAD1O00515 517 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZNF862O60290 1169 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 CTSHP09668 335 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 IQCF3P0C7M6 154 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ATP4AP20648 1035 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 SYT1P21579 422 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EPHB4P54760 987 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EPHA7Q15375 998 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 XKR3Q5GH77 459 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 GPR153Q6NV75 609 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 FERMT3Q86UX7 667 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 NEK9Q8TD19 979 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 LXNQ9BS40 222 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.99□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TET1Q8NFU7 2136 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 STX6O43752 255 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 C22orf31O95567 290 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RSPH10BP0C881 870 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 CYP4A11Q02928 519 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PTGDRQ13258 359 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RPAINQ86UA6 219 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ERMNQ8TAM6 284 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 DYDC2Q96IM9 177 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RAB34Q9BZG1 259 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.98□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 M0QZ92 97 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MAGEB2O15479 319 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 SLC34A2O95436 690 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 BMP15O95972 392 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ACRP10323 421 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ACTN1P12814 892 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 KLRC1P26715 233 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 PRPHP41219 470 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TECP42680 631 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 RESTQ13127 1097 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 BECN1Q14457 450 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 SHHQ15465 462 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 MTERF2Q49AM1 385 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 FAM26DQ5JW98 314 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TMEM240Q5SV17 173 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.97□□□□□ -0.81
CU633967.1-208ENST00000624412 ZNF365Q70YC5 407 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms