RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	TSG101	Q99816	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO1C	O00159	1063 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	OPLAH	O14841	1288 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC175	P0C221	793 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	GLG1	Q92896	1179 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MSH4	O15457	936 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	PEX3	P56589	373 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	RAD54L	Q92698	747 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	KLRG1	Q96E93	195 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		10.77	□□□□□ -0.68
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	PSEN1	P49768	467 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM20A	Q96MK3	541 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	EPHB6	O15197	1021 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CCP110	O43303	1012 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC16A4	O15374	487 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MYL1	P05976	194 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	BIRC3	Q13489	604 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232		K7ENM7	598 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3R2	O00459	728 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	VPS41	P49754	854 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	MOCS3	O95396	460 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC9A1	P19634	815 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	VGLL4	Q14135	290 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	P2RX5	Q93086	422 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	VWA5A	O00534	786 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT5	P13647	590 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	EPHX2	P34913	555 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	GCLM	P48507	274 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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