RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 ADAM2Q99965 735 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 SQORQ9Y6N5 450 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF213O14771 459 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ATP9AO75110 1047 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RFX1P22670 979 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KRT76Q01546 638 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PLCB3Q01970 1234 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 DENND4AQ7Z401 1863 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 C2orf71A6NGG8 1288 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RRN3P2A6NIE6 340 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 EOMESO95936 686 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 NLRX1Q86UT6 975 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PLCD3Q8N3E9 789 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF558Q96NG5 402 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PPP1R16BQ96T49 567 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 UBAC1Q9BSL1 405 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CYP26B1Q9NR63 512 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 MAD2L2Q9UI95 211 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 C9IYK1 514 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RPS6KA5O75582 802 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KCNA2P16389 499 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KRT17Q04695 432 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TDGQ13569 410 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PLCB4Q15147 1175 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SPECC1Q5M775 1068 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RUBCNQ92622 972 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RGS18Q9NS28 235 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CFHP08603 1231 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 EPCAMP16422 314 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PPM1AP35813 382 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ST3GAL2Q16842 350 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 USTQ9Y2C2 406 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 LRRC43Q8N309 656 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PCYT2Q99447 389 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SPG21Q9NZD8 308 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CA14Q9ULX7 337 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CYTH3O43739 400 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TRAF1Q13077 416 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RNF169Q8NCN4 708 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 GPRASP2Q96D09 838 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 CASD1Q96PB1 797 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 AZI2Q9H6S1 392 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 KCNK12Q9HB15 430 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-236ENST00000602111 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.95■□□□□ 0.14
FCHO1-236ENST00000602111 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms