RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LGR5O75473 907 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KAT2BQ92831 832 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 JADE2Q9NQC1 790 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP45Q9UL16 551 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MEIS1O00470 390 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 EDIL3O43854 480 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RPAINQ86UA6 219 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 AFG1LQ8WV93 481 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM221A6NGB7 291 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 M0R296 226 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LAD1O00515 517 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX3O15119 743 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP3P08254 477 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ICAM3P32942 547 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PTK7Q13308 1070 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MBTPS1Q14703 1052 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM192Q8IY95 271 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM86B1E9PN63 330 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FIBPO43427 364 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MBTPS2O43462 519 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 NEMFO60524 1076 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ARIH2O95376 493 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TDP2O95551 362 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2B1P20020 1258 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT85P78386 507 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 C7orf31Q8N865 590 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 EMSYQ7Z589 1322 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TGFB3P10600 412 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGB5P18084 799 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR1Q13613 665 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR16Q569H4 304 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 YME1L1Q96TA2 773 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM7P33993 719 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-214ENST00000592483 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 LENG9Q96B70 501 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 YEATS4O95619 227 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GH1P01241 217 aa26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-214ENST00000592483 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CLUL1Q15846 466 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL6Q8N531 539 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM20AQ96MK3 541 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 USP28Q96RU2 1077 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT7AO00755 349 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC37A4O43826 429 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS20O76081 388 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-214ENST00000592483 DGKDQ16760 1214 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-214ENST00000592483 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPHP41219 470 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP1Q07960 439 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NBR1Q14596 966 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEDQ86YR6 584 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT8BQ93098 351 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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