RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 ODR4Q5SWX8 454 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 WASF1Q92558 559 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 MBOAT7Q96N66 472 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 AIFM3Q96NN9 605 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 ASB2Q96Q27 587 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 CD52P31358 61 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 AAK1Q2M2I8 961 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 PADI3Q9ULW8 664 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 COG5Q9UP83 839 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 PSMD10O75832 226 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 C22orf31O95567 290 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 PAK2Q13177 524 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 KRT40Q6A162 431 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 TDP2O95551 362 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 EPC2Q52LR7 807 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 FIBCD1Q8N539 461 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.33■□□□□ 0.85
CTIF-209ENST00000591387 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.33■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CTDNEP1O95476 244 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 OATP04181 439 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 STAG3L1P0CL83 205 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 TMOD1P28289 359 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 INF2Q27J81 1249 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 TMEM192Q8IY95 271 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 H3BNC9 293 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CHMP2AO43633 222 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ZNF862O60290 1169 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 RPS6KA5O75582 802 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 DGKIO75912 1065 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 RB1P06400 928 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NEK4P51957 841 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ME3Q16798 604 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 PTPROQ16827 1216 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NEK8Q86SG6 692 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 METTL13Q8N6R0 699 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 IL27Q8NEV9 243 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GTF3C6Q969F1 213 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 FAM20AQ96MK3 541 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GINS2Q9Y248 185 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GPR182O15218 404 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 PRKCEQ02156 737 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 LETM2Q2VYF4 491 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 HLA-CQ95604 372 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 MAP7D2Q96T17 732 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GPM6BQ13491 265 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 XKR3Q5GH77 459 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GJA10Q969M2 543 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 TMX1Q9H3N1 280 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 TBX3O15119 743 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 GPR32O75388 356 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 BMPR1AP36894 532 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-209ENST00000591387 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms