RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM199Q8N511 208 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 DYDC2Q96IM9 177 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 GDF15Q99988 308 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SCN5AQ14524 2016 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 CAND2O75155 1236 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 C4orf19Q8IY42 314 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 RETREG2Q8NC44 543 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ERMNQ8TAM6 284 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ARID2Q68CP9 1835 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SPTLC2O15270 562 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 STBD1O95210 358 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 CKBP12277 381 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ME1P48163 572 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 FPGSQ05932 587 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 PDIA5Q14554 519 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SLC39A14Q15043 492 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 SLITRK3O94933 977 aa22.52■■□□□ 1.2
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ATG4D-208ENST00000588667 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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ATG4D-208ENST00000588667 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 RPAINQ86UA6 219 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 TPH2Q8IWU9 490 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 LYPLA2O95372 231 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 KLRC1P26715 233 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 THPOP40225 353 aa22.51■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 ANO5Q75V66 913 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 STK24Q9Y6E0 443 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 C22orf31O95567 290 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 IQCF3P0C7M6 154 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 CSF2RAP15509 400 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 14.2
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ATG4D-208ENST00000588667 TET1Q8NFU7 2136 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 MAGEB2O15479 319 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 PTPAQ15257 358 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 PRO3102Q9H379 93 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 RFC2P35250 354 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 MTERF2Q49AM1 385 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 ADALQ6DHV7 355 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 SIP14410 1827 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 MED24O75448 989 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 MUTP22033 750 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.48■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 CEP89Q96ST8 783 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 A0A1W2PQ27 194 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 A0A1W2PQ64 194 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 A0A1W2PQD8 194 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.47■■□□□ 1.19
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ATG4D-208ENST00000588667 RSPH10BP0C881 870 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4D-208ENST00000588667 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.47■■□□□ 1.19
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