RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 GPC5P78333 572 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ADAM17P78536 824 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ATP8B2P98198 1209 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PRKCQQ04759 706 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MTX1Q13505 466 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HSDL1Q3SXM5 330 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 KCNT2Q6UVM3 1135 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SLC30A10Q6XR72 485 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MAMSTRQ6ZN01 415 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RSPH3Q86UC2 560 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CABP7Q86V35 215 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PROSER1Q86XN7 944 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CNPY4Q8N129 248 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RGS22Q8NE09 1264 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SLC22A17Q8WUG5 538 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CLEC4DQ8WXI8 215 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LINC01599Q8WXQ3 324 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SSH1Q8WYL5 1049 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 TBC1D5Q92609 795 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CLDN23Q96B33 292 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 GMCL1Q96IK5 515 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LRIG1Q96JA1 1093 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA33Q96N06 139 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 KLHL5Q96PQ7 755 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MYADMQ96S97 322 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 IWS1Q96ST2 819 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MEIS3Q99687 375 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 USP26Q9BXU7 913 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CWH43Q9H720 699 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SPG21Q9NZD8 308 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HCSTQ9UBK5 93 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PADI3Q9ULW8 664 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MSRB2Q9Y3D2 182 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MRVI1Q9Y6F6 885 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 F5P12259 2224 aa2.84□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NAV1Q8NEY1 1877 aa2.84□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KAT6AQ92794 2004 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 C4orf47A7E2U8 309 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ANHXE9PGG2 379 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 J3QKU1 62 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ANP32CO43423 234 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PRDM1O75626 825 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MBD4O95243 580 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GGPS1O95749 300 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CAPNS1P04632 268 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 APPP05067 770 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NR3C2P08235 984 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 GNAI3P08754 354 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TDGF1P13385 188 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 LAMP2P13473 410 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CEACAM1P13688 526 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PLA2G2AP14555 144 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CNR2P34972 360 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SLC16A2P36021 539 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SARSP49591 514 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 FAM193AP78312 1265 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 ARHGAP4P98171 946 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SP2Q02086 613 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MGAT3Q09327 533 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TROAPQ12815 778 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MTAPQ13126 283 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 FZD5Q13467 585 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 PPP2R5DQ14738 602 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SLFNL1Q499Z3 407 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 SBK1Q52WX2 424 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RNF43Q68DV7 783 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TTBK2Q6IQ55 1244 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TAF2Q6P1X5 1199 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 KCNV1Q6PIU1 500 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53-201ENST00000579969 CEP68Q76N32 757 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms