RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POLD4	Q9HCU8	107 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAPK7	Q13164	816 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ODR4	Q5SWX8	454 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CETN3	O15182	167 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STX10	O60499	249 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OFD1	O75665	1012 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SP2	Q02086	613 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ADAM9	Q13443	819 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VWA3B	Q502W6	1294 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	XKR9	Q5GH70	373 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FIZ1	Q96SL8	496 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GYPC	P04921	128 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HOXD13	P35453	343 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NEDD9	Q14511	834 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WDR78	Q5VTH9	848 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BACH1	O14867	736 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MFAP3L	O75121	409 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATG7	O95352	703 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PGK2	P07205	417 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ALCAM	Q13740	583 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CEP135	Q66GS9	1140 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DAW1	Q8N136	415 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DRC1	Q96MC2	740 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGAP6	O43182	974 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CASP14	P31944	242 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM139	Q8IV31	216 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NUP58	Q9BVL2	599 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NDST4	Q9H3R1	872 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NR2F2	P24468	414 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANO5	Q75V66	913 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IQCD	Q96DY2	449 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FGD4	Q96M96	766 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NFIL3	Q16649	462 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RETREG2	Q8NC44	543 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MORC4	Q8TE76	937 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARID2	Q68CP9	1835 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF862	O60290	1169 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PLS3	P13797	630 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SP4	Q02446	784 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PORCN	Q9H237	461 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STBD1	O95210	358 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STRA6	Q9BX79	667 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EFCC1	Q9HA90	598 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCP110	O43303	1012 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CST9	Q5W186	159 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASB14	A6NK59	587 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NPEPPS	P55786	919 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	XKR3	Q5GH77	459 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CEP170P1	Q96L14	293 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF302	Q9NR11	478 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM150B	A6NC51	233 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP1R37	O75864	691 aa		32.05	■■■□□ 2.72

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