RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 TCEAL1Q15170 157 aa6.99□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 BRF1Q92994 677 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-204ENST00000569773 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.99□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.99□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.97□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 CHST7Q9NS84 486 aa6.97□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 MGAMO43451 1857 aa6.96□□□□□ -1.29
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GDE1-204ENST00000569773 RASGRF1Q13972 1273 aa6.96□□□□□ -1.3
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GDE1-204ENST00000569773 CFAP100Q494V2 611 aa6.96□□□□□ -1.3
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GDE1-204ENST00000569773 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 TEPSINQ96N21 525 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 APBA2Q99767 749 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GDE1-204ENST00000569773 JAG2Q9Y219 1238 aa6.96□□□□□ -1.3
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