RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	LY9	Q9HBG7	655 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	NRCAM	Q92823	1304 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		5.21	□□□□□ -1.57
TTC7B-210	ENST00000556749	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ENPP3	O14638	875 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LILRB3	O75022	631 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	DDAH1	O94760	285 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	AMH	P03971	560 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	IL9	P15248	144 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LIFR	P42702	1097 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TRDN	Q13061	729 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LPIN1	Q14693	890 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	WTAP	Q15007	396 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	DESI1	Q6ICB0	168 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM192	Q8IY95	271 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GJD3	Q8N144	294 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	IL27	Q8NEV9	243 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	APBB2	Q92870	758 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SAMD11	Q96NU1	681 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PCYT2	Q99447	389 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GRM6	O15303	877 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	DGKI	O75912	1065 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RB1	P06400	928 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	CTSH	P09668	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GNAT1	P11488	350 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNA5	P22460	613 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	BMPR1A	P36894	532 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ZP2	Q05996	745 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GPM6B	Q13491	265 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TMTC2	Q8N394	836 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	BANK1	Q8NDB2	785 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MYO7A	Q13402	2215 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ERICH2	A1L162	156 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PRR33	A8MZF0	331 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MEIS1	O00470	390 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC27A2	O14975	620 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MAFG	O15525	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	PRC1	O43663	620 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ATG7	O95352	703 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MMP1	P03956	469 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GHR	P10912	638 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	INSRR	P14616	1297 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	DNAJB1	P25685	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	KIF5B	P33176	963 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	MCM5	P33992	734 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	GNAQ	P50148	359 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP4	P98171	946 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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