RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1B0GVL5 298 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 M0R2N6 131 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 STXBP3O00186 592 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 GH1P01241 217 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF543Q08ER8 600 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF4Q8WV16 495 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 YME1L1Q96TA2 773 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PNMA2Q9UL42 364 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 COL4A6Q14031 1691 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ESYT2A0FGR8 921 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PFKFB1P16118 471 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP1Q07960 439 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CLUL1Q15846 466 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 DGKDQ16760 1214 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC96Q2M329 555 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SHC4Q6S5L8 630 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 WNT8BQ93098 351 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TOP1MTQ969P6 601 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF202O95125 648 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC16A2P36021 539 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PSEN2P49810 448 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR7Q9Y216 660 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.45■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 LY6KQ17RY6 165 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 TTC38Q5R3I4 469 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXL6Q8N531 539 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 GNA11P29992 359 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 SYKP43405 635 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 HYAL1Q12794 435 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF214Q8ND24 703 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA1HO95180 2353 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 HAS3O00219 553 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 RSPH10BP0C881 870 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ZXDAP98168 799 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD10Q14728 455 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR8Q96EF0 704 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 SDF4Q9BRK5 362 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 C6orf50Q9HD87 102 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 CD207Q9UJ71 328 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM205CA6NFA0 338 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 RB1P06400 928 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 STX1AQ16623 288 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA1AO00555 2505 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 UPP2O95045 317 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 F2P00734 622 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 CLIC6Q96NY7 704 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PIGSQ96S52 555 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 TBX10O75333 385 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-204ENST00000548823 THPOP40225 353 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms