RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MARCH6O60337 910 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GJB2P29033 226 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 KCNJ6P48051 423 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CLCN3P51790 818 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GRIN2CQ14957 1233 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF174Q15697 407 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CALCRLQ16602 461 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SPRED2Q7Z698 418 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SEPT8Q92599 483 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 FAM167AQ96KS9 214 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MTMR9Q96QG7 549 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CEP89Q96ST8 783 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SLC9A7Q96T83 725 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF576Q9H609 170 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 RGL1Q9NZL6 768 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.89□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NEMFO60524 1076 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 VTNP04004 478 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CD52P31358 61 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TXKP42681 527 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MCM2P49736 904 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 RAB30Q15771 203 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ANO5Q75V66 913 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 METTL13Q8N6R0 699 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MSRAQ9UJ68 235 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.88□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LCHNA4D1U4 455 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ZBTB39O15060 712 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CA3P07451 260 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PSMC5P62195 406 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CYP4A11Q02928 519 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 DRP2Q13474 957 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MTERF2Q49AM1 385 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 XKR3Q5GH77 459 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 IER5Q5VY09 327 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MYLIPQ8WY64 445 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 DYDC2Q96IM9 177 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GINS2Q9Y248 185 aa14.87□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 POTEMA6NI47 508 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GPR32O75388 356 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NPEPPSP55786 919 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 EPHA7Q15375 998 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 KIZQ2M2Z5 673 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TTC38Q5R3I4 469 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 NME8Q8N427 588 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 IL27Q8NEV9 243 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 LXNQ9BS40 222 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.86□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 A0A087WWV3 80 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 M0QZ92 97 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 TLL1O43897 1013 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 GJB5O95377 273 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 CUL4AQ13619 759 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 MCTP1Q6DN14 999 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 OSMRQ99650 979 aa14.85□□□□□ -0.03
TPCN1-211ENST00000548465 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms