RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM247A6NEH6 219 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L15C9J2P7 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L11C9JVI0 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L18D6R9N7 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L22D6RA61 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L19D6RCP7 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L20D6RJB6 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 KRT1P04264 644 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MYBL1P10243 752 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 EPHB4P54760 987 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZBED6P86452 979 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L24Q0WX57 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TMCC1O94876 653 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TAC1P20366 129 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCA1P28370 1054 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MCAMP43121 646 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CUL4AQ13619 759 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF699Q32M78 642 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 KLC2Q9H0B6 622 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 COX16Q9P0S2 106 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf81C9J6K1 198 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LRRN2O75325 713 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PEX3P56589 373 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 Q3C1V9 767 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ATG16L1Q676U5 607 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CENPUQ71F23 418 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ACAD9Q9H845 621 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 USP31Q70CQ4 1352 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 GPC4O75487 556 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LONRF3Q496Y0 759 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ACAP3Q96P50 834 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDE4D-226ENST00000546160 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 OSBP2Q969R2 916 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINI1Q99574 410 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CDC23Q9UJX2 597 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PSMA2P25787 234 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 IFNA8P32881 189 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 EHHADHQ08426 723 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SREBF2Q12772 1141 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 VEPH1Q14D04 833 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ALS2CLQ60I27 953 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CALN1Q9BXU9 219 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PFASO15067 1338 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CLIC2O15247 247 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FOXP2O15409 715 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SLC8A1P32418 973 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 E2F5Q15329 346 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 VPS72Q15906 364 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 DEPDC5O75140 1603 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC3O43617 180 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZBED1O96006 694 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SAT1P21673 171 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 GRM4Q14833 912 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MUM1Q2TAK8 710 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.87□□□□□ -1.31
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