RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	IGFLR1	Q9H665	355 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf50	Q9HD87	102 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	COL1A2	P08123	1366 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	RPS6KA5	O75582	802 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ATP4A	P20648	1035 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CAMK1	Q14012	370 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KCNB2	Q92953	911 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	BRF1	Q92994	677 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ITGB1	P05556	798 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ALAD	P13716	330 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GATM	P50440	423 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PKN1	Q16512	942 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ODR4	Q5SWX8	454 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MGEA5	O60502	916 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJB1	P25685	340 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GNA11	P29992	359 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZP2	Q05996	745 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CLUL1	Q15846	466 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ADAM2	Q99965	735 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DENND3	A2RUS2	1198 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	GPR182	O15218	404 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01565	O15544	149 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MBTPS2	O43462	519 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C22orf31	O95567	290 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PSAP	P07602	524 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	HSPA4	P34932	840 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ADAM15	Q13444	863 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PRR16	Q569H4	304 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	POF1B	Q8WVV4	589 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PHKB	Q93100	1093 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RGS18	Q9NS28	235 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NID2	Q14112	1375 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PRR33	A8MZF0	331 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TBX10	O75333	385 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RPS6KB1	P23443	525 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	IRS1	P35568	1242 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FBXL16	Q8N461	479 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	METTL13	Q8N6R0	699 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	BICD2	Q8TD16	824 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	OSMR	Q99650	979 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SAMM50	Q9Y512	469 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	DCX	O43602	365 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PPFIA3	O75145	1194 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	VTN	P04004	478 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CIITA	P33076	1130 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFV1	P49821	464 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5

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