RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 UBE4BO95155 1302 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TUBBP07437 444 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PRLRP16471 622 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RASSF7Q02833 373 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DGKZQ13574 1117 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TNFAIP1Q13829 316 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SLC18A3Q16572 532 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 WDR93Q6P2C0 686 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NEK9Q8TD19 979 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 JADE2Q9NQC1 790 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 UCHL3P15374 230 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GUCY2CP25092 1073 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 USP14P54578 494 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TNIP1Q15025 636 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 BANK1Q8NDB2 785 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ABCB6Q9NP58 842 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GINM1Q9NU53 330 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MAPK7Q13164 816 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CREG2Q8IUH2 290 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 STRA6Q9BX79 667 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SIX2Q9NPC8 291 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 L1RE1Q9UN81 338 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DOCK1Q14185 1865 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 A0A087X0T9 212 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FAM228BP0C875 321 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TERF2Q15554 542 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ASIC2Q16515 512 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DAW1Q8N136 415 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ERLIN1O75477 346 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PPP1R37O75864 691 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ALAS1P13196 640 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 COG2Q14746 738 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TKFCQ3LXA3 575 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GBP6Q6ZN66 633 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KSR1Q8IVT5 923 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CPXCR1Q8N123 301 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 COG1Q8WTW3 980 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DMAC2Q9NW81 257 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 VCAM1P19320 739 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ARID5AQ03989 594 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ODR4Q5SWX8 454 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NOX5Q96PH1 765 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 RLFQ13129 1914 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 HIP1RO75146 1068 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 JAM2P57087 298 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMK1-208ENST00000538333 PTK2Q05397 1052 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms